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Aliments

Des scientifiques étudient le lien entre Clostridioides difficile et les pommes de terre

potatoes illustration

Le rôle de l’alimentation dans les chaînes de transmission de Clostridioides difficile doit encore être clarifié, selon une étude.

L’infection à Clostridioides difficile (ICD) est une cause notable de diarrhée infectieuse dans le monde.

La transmission interhumaine joue un rôle majeur, mais d’autres sources et voies d’infection sont à l’étude. Clostridioides difficile a été isolé dans divers aliments et les experts pensent qu’il est possible que certains d’entre eux puissent être des vecteurs importants pour sa large diffusion.

Les preuves existantes suggèrent que les pommes de terre, qui représentent un aliment de base majeur consommé dans le monde, pourraient contribuer à la propagation de Clostridioides difficile. Ils ont les taux de contamination les plus élevés parmi les légumes testés à ce jour. Les cas confirmés d’ICD d’origine alimentaire n’ont pas encore été décrits.

COMBACTE-CDI (Combatting Bacterial Resistance in Europe) est un consortium européen d’experts issus de huit organismes universitaires et de recherche et de six partenaires industriels.

L’un des travaux consiste à fournir des informations actualisées sur Clostridioides difficile dans les aliments à travers l’Europe. Pour ce faire, le consortium a collecté des échantillons cliniques, animaux et alimentaires dans 12 pays. Les résultats ont été publiés dans le revue Eurosurveillance.

Des pommes de terre ont été échantillonnées en Pologne, en Roumanie, en Slovaquie, en Autriche, en France, aux Pays-Bas, au Royaume-Uni, en Irlande, en Suède, en Grèce, en Italie et en Espagne entre janvier et juillet 2018. Le nombre d’échantillons dans chaque pays variait de six en Irlande à 29 dans le Royaume-Uni et elles ont été recueillies auprès de cinq à 20 détaillants par pays.

Rôle des pommes de terre positives dans l’infection
Dans l’ensemble, 33 des 147 échantillons ont été testés positifs pour Clostridioides difficile. Les neuf échantillons de Slovaquie étaient négatifs et les sept de Roumanie étaient positifs. Les taux de positivité d’un pays à l’autre variaient considérablement.

Seuls 13 échantillons de pommes de terre ont été importés, la plupart d’autres pays de l’UE, mais un des États-Unis, un d’Israël et un d’Égypte.

Il y avait une différence significative dans la proportion d’échantillons positifs pour Clostridioides difficile entre les pommes de terre visiblement propres et celles modérément ou excessivement recouvertes de terre, ces dernières étant les plus contaminées.

Des taux élevés de contamination de la pomme de terre pourraient avoir une pertinence potentielle pour la santé publique, ont déclaré les chercheurs. Ils ont ajouté que de très grands échantillons seront nécessaires pour comprendre l’étendue et la pertinence de Clostridioides difficile dans les aliments.

Les pommes de terre sont généralement lavées, pelées et cuites avant d’être consommées, ce qui réduit le risque qu’elles puissent être une source directe d’infection. Cependant, ils peuvent servir de vecteur pour introduire des spores de Clostridioides difficile dans l’environnement domestique et/ou la chaîne alimentaire, où ils pourraient persister.

Les ribotypes de PCR prévalents détectés dans l’étude chevauchent les types de Clostridioides difficile trouvés chez les humains, les animaux et le sol.

« Les pommes de terre pourraient servir de vecteur de propagation des spores entre les pays et de contamination des environnements domestiques. De telles expositions constantes combinées à un microbiote intestinal temporairement perturbé (résistance altérée à la colonisation) peuvent alors contribuer à l’apparition d’ICD associées à la communauté », ont déclaré les chercheurs.

Propagation chez les humains et les porcs
D’autres recherches, présentées lors de la réunion annuelle du Congrès européen de microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID) à Lisbonne, ont fourni des preuves de la transmission de Clostridioides difficile entre animaux et humains.

« Notre découverte de gènes de résistance multiples et partagés indique que Clostridioides difficile est un réservoir de gènes de résistance aux antimicrobiens qui peuvent être échangés entre les animaux et les humains. La surutilisation des antibiotiques en médecine humaine et en tant qu’outils de production bon marché dans les fermes détruit notre capacité à guérir les infections bactériennes », a déclaré Semeh Bejaoui.

Bejaoui et ses collègues de l’Université de Copenhague et du Statens Serum Institut ont étudié des échantillons de Clostridioides difficile dans 14 élevages porcins au Danemark et des isolats cliniques de patients hospitalisés.

Le séquençage du génome a comparé les isolats d’échantillons de porcs à ceux prélevés sur des patients infectés par Clostridioides difficile en 2020 et 2021. Sur 514 échantillons de porcs, 54 ont montré des signes de Clostridioides difficile. Treize types de séquences trouvés chez les animaux correspondaient à ceux des échantillons de selles des patients.

Les auteurs ont noté plusieurs limites du travail non encore publié, notamment la direction de la transmission qui n’est pas claire.

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